Fiskeretten til et stykke vandløb har bredejeren. Fiskeretten kan dog være givet til andre - som regel en sportsfiskerforening.

På Danmarks Sportsfiskerforbunds hjemmeside kan du blandt andet se, hvilke vandløbsstrækninger de fynske sportsfiskerforeninger råder over, og hvor der kan købes fiskekort.

Du skal desuden have et lystfisketegn for at fiske i vandløbene. Dog ikke hvis du er under 18 år eller på folkepension. Bredejeren og dennes husstand er også undtaget herfra på det vandløbsstykke, som støder op til grunden. Lystfisketegnet kan du blandt andet købe på posthuset eller her.

Mindstemål og fredningstider for fisk i vandløb kan du se på Fiskeridirektoratets hjemmeside.
Du kan læse mere om lovgivningen omkring fiskeri i Fiskeriloven og i Bekendtgørelsen om rekreativt fiskeri i salt- og ferskvand samt redskabsfiskeri mv. i ferskvand.

Havørred Fyn
Havørred Fyn er et storstilet miljøprojekt, der sigter mod at tiltrække lystfiskere fra hele Europa. Projektet består af tre dele:
• Fiskeudsætninger
• Vandløbsrestaurering
• Markedsføring

Projektet er med til at profilere Fyn som en grøn ø og en spændende turistdestination.
Som følge af strukturreformen er Havørred Fyn projektet, som tidligere blev varetaget af Fyns Amt, overgået til Svendborg Kommune og de øvrige fynske kommuner. De viderefører nu projektet i fællesskab. Odense Kommune varetagere sekretariatsfunktionen.
Flere oplysninger kan fås på Havørred Fyns hjemmeside ...

Udsætning af fisk
I de fynske vandløb udsættes ørreder de steder, hvor der ikke naturligt kan opretholdes en ørredbestand. Det kan være vandløbsstrækninger, hvor gydeforholdene er ringe, eller hvor ørrederne ikke kan få adgang til gydepladserne for eksempel på grund af opstemninger og spærringer.

På Fyn udsættes årligt cirka 600.000 stk. ørreder, hvoraf de 500.000 udsættes i vandløbsmundingerne og 100.000 stk. højere oppe i vandløbene.
Udsætningerne foretages på baggrund af en udsætningsplan, som er udarbejdet af DTU Aqua..
Udsætningsplanen revideres med 7-9 års mellemrum. Den sidste udsætningsplan er fra 2009: Udsætningsplan for fynske vandløb - 0901.
Hovedparten af udsætningerne i de fynske vandløb foretages af Fyns Laksefisk, der er en del af Elsesminde Odense Produktions-højskole.
De står også for opdræt af ørredynglen. Moderfisk til yngelproduktionen indsamles hovedsageligt af de fynske sportsfiskerforeninger i fynske vandløb.
Udsætning af fisk eller krebs kræver tilladelse, som søges gennem Fiskeridirektoratet.
Læs mere om fiskeudsætninger.

Mindstemål og fredningstider for fisk kan du se på Fiskeridirektoratets hjemmeside. Du kan endvidere læse mere om lovgivningen omkring fiskeri i Bekendtgørelse om rekreativt fiskeri.
På Danmarks Sportsfiskerforbunds hjemmeside er der en omtale af søer, hvor det er muligt at fiske. Desuden er der en del put and take søer på Fyn. Se også oversigten på sportsfiskernes hjemmeside.
Fiskeri i søerne er underlagt reglerne i Fiskeriloven.

Læs mere detaljeret information om de forskellige bestemmelser om vandløb: 
- Bremme langs vandløb  (læs mere)
- Våde og oversvømmede marker  (læs mere)
- Kommunens vandløb  (læs mere) 
- Omlægning og regulering af vandløb  (læs mere)
- Sejlads på søer og vandløb  (læs mere)
- Vandløbsvedligeholdelse  (læs mere)
- Vandløbsrestaurering  (læs mere)